如果单位在本月底交的是本月的社保，但是显示是补缴，这通常是因为单位在员工上一次缴纳社保后，没有及时为新员工办理社保增员手续，导致员工本月的社保没有正常缴纳。因此，单位在本月底补缴了员工本月的社保费用。
出现社保补扣的原因包括用人单位工作人员原因、社保政策调整原因、员工离职结算原因、劳动者个人原因、财务对账需要。
用人单位工作人员原因：相关工作人员对社保应缴费金额数据处理有误。单位代扣费金额和社保实际应缴金额不一致，需要二次处理。
社保政策调整原因：有的时候是因为社保缴费基数，缴费费率因政策变化出现调整，需要补差。