在第四次忍界大战中,药师兜救佐助是为了帮助忍者联盟对抗大筒木辉夜。兜利用秽土转生之术,转生出了许多以前死去的忍者,虽然是用来对抗忍者联盟的,但也制造了亲人相认的机会,还解除了一些人心里的纠结。特别是佐助对鼬的羁绊,佐助有机会再次见到哥哥,并且深入地了解了哥哥。
药师兜的这一行为也为击败大筒木辉夜埋下了伏笔。
第476集,在五影会谈之时,带土对五影宣布第四次忍界大战开始,以后准备了十万白绝的战力,这时候兜突然出现要加入战争,并且要获得佐助。带土拒绝,两个人开战,但是药师兜秽土出来秽土转生大军,还有一个宇智波,带土被吓到,无奈之下只好和兜合作