如果工厂工人在上班期间患上肺结节，需要先进行医疗治疗，确诊为工伤后，建议立即向工厂提出申请工伤赔偿，提供相关证明材料，包括职业加重因素鉴定和医院开立的工伤证明等。

根据工伤保险条例，工厂需要按照相关规定赔偿工人的医疗费、住院误工费、丧失劳动能力补偿金等相关费用。

如果工厂对赔偿给予拒绝或者未按规定的方式进行赔偿，工人可以通过劳动争议仲裁、诉讼等方式维护自己的合法权益。