北京农村户口可以申请公租房，不能申请可能是因为不符合规定的条件。

根据《公共租赁住房管理办法》第七条　申请公共租赁住房，应当符合以下条件：

(一)在本地无住房或者住房面积低于规定标准;

(二)收入、财产低于规定标准;

(三)申请人为外来务工人员的，在本地稳定就业达到规定年限。

具体条件由直辖市和市、县级人民政府住房保障主管部门根据本地区实际情况确定，报本级人民政府批准后实施并向社会公布。