江西上饶的6层自建房是否算违建，取决于该建筑是否符合当地的建筑规定和法规。

据江西省政府官网，江西省在2016年10月出台了《关于进一步加强农村建房规划管理的意见》，其中明确提出要严格执行农村建房建设标准，从严控制农房建筑体量，建筑面积不得突破350平方米，建筑层数一般不超过三层。此外，即将实施的《江西省农村村民自建房管理办法》也强调，村民自建住房不得突破350平方米，一般不应超过三层。

因此，如果上饶的6层自建房建筑面积超过了350平方米，或者其建筑层数超过了三层，那么该建筑就可能被视为违建。然而，具体情况还需要根据当地的具体规定和实际情况进行判断。如果有任何疑问，建议咨询当地的规划、建设等相关部门。