婚检有效期三个月的起算时间通常是从婚检完成并出具合格证明的那一天开始算起。这个有效期的设定是为了确保在婚姻登记前，双方的身体健康状况是符合结婚要求的。在婚检有效期三个月内，新人可以凭借婚检合格证明去民政局进行婚姻登记。如果超过了三个月的有效期，可能需要重新进行婚检。
婚检有效期三个月是从婚检结果出来的那一天开始算起的。这意味着，新人必须在三个月内，即90天内完成婚姻登记。
男女婚检的好处：
1.婚检有利于优生，结婚和生养都是人生的大事，是否能孕育出一个健康、聪明、活泼、可爱的小宝宝必须建立在科学的基础上，通过家族史的调查和身体检查，可以发现遗传病和遗传缺陷方面的问题，这样医生会对生养进行必要的指导，避免遗传病儿或畸形儿出现。
2.婚检有利于身体健康，实在婚检也就是对自己身体做一个具体检查，通过检查我们可以增加对自己身体了解，做好预防工作，有问题早发现早解决。
3.婚检有利于计划生养。
婚检对男女青年的健康、婚后健康的夫妻生活及优生有着重要的作用。
是减少遗传性疾病，减少把生理缺陷和不健康因素传给后代的关键，是实现后代优生的重要措施。
因此，男女双方应把婚检作为婚配前必不可少的程序。